休閒遊覽船能通過大型遊覽船無法到達的地方，巡遊特殊的航線。因為離水面很近，可以近距離的欣賞九十九島的四季美景。除此之外對於九十九島熟知的船長還會講解關於九十九島的趣事。
通常船班
| 期間 | 全年 |
| 出航時刻 | 10：20／11：20／12：20／13：20／14：20／15：20／16：20 ※10：20的船班將在6月、7月停運 ※16：20的船班將在10月停運。 |
| 所需時間 | 約50分 |
| 定員 | 12名 |
| 支付方式 | 現金或信用卡 |
| 預約方式 | 請通過電話預約 ※當天，在售票口也接受申請。請提前確認空餘狀況後來場。 |
| 乘船費用 | 成人（高中生以上） | 兒童（4歲～國中生） |
| 通常票價 | 2,200日圓 | 1,100日圓 |
- 出示通常票價購買的海閃閃或森閃閃門票後有優惠價格。
- 持有殘障人士手冊有優惠價格。
- 7-11便利店的實惠套票信息請從此處查詢
包船遊覽
| 期間 | 全年 |
| 出航時刻 | 9：00～17：00之間，根據客人的需求出航。 |
| 所需時間 | 最長90分 |
| 定員 | 12名 |
| 支付方式 | 現金或信用卡 |
| 預約方式 | 請提前一周通過電話預約。 ※當天，根據空餘狀況也可在售票口接受申請。請提前確認空餘狀況後來場。 |
| 注意事項 | ※可以帶飲料食品乘船。 ※如您要取消預約請提前1天聯繫。 |
| 包船費用 | 32,000日幣 |
期間限定日落觀光遊
| 期間 | 3月～10月 ※3月～7月僅在週五週六週日及日本法定假日運航。 ※8月～10月每日運航。 |
| 出航時刻 | 根據日落時間運行（需提前諮詢） |
| 所需時間 | 約60分 |
| 定員 | 12名 |
| 支付方式 | 現金或信用卡 |
| 預約方式 | 請通過電話預約。 |
| 注意事項 | ※當天、出航1小時前也接受申請。請確認空餘狀況後來場。 |
| 乘船費用 | 成人（高中生以上） | 兒童（4歲～國中生） |
| 通常票價 | 2,800日圓 | 1,700日圓 |
- 出示通常票價購買的海閃閃或森閃閃門票後有優惠價格。
- 持有殘障人士手冊有優惠價格。
- 7-11便利店的實惠套票信息請從此處查詢
期間限定九十九島休閒觀光遊加海鮮套餐
可以炭烤九十九島冬日美味牡蠣和扇貝。
※請勿攜帶食材。
| 期間 | 11月～3月※年末年初（12月28日～1月4日）停運。 |
| 出航時刻 | 11：00/13：00 |
| 所需時間 | 約2小時30分 |
| 定員 | 12名（最少開催人數為2名） |
| 支付方式 | 現金或信用卡 |
| 預約方式 | 請提前通過電話預約。 |
| 海鮮套餐內容 | 成人（高中生以上） | 牡蠣1kg、海螺1個、扇貝1個、烤飯糰2個 ※大蝦1只或是鮑魚一隻 |
| 兒童（4歲～國中生） | 牡蠣1kg、扇貝1個、烤飯糰2個、烤腸2根 |
※根據進貨的狀況大蝦或是鮑魚可能會變化。
| 乘船費用 | 成人（高中生以上） | 兒童（4歲～國中生） |
| 通常票價 | 5,500日圓 | 3,400日圓 |
- 出示通常票價購買的海閃閃或森閃閃門票後有優惠價格。
- 持有殘障人士手冊有優惠價格。
- 7-11便利店的實惠套票信息請從此處查詢
